شینجوتسو (Shinjutsu) تکنیک‌هایی با بالاترین رده هستند که عمدتا توسط اعضای قبیله اوتسوتسوکی استفاده می‌شود. بنا بر گفته آمادو، تمام فنون نینجوتسو اقدامی برای بازتولید اثر شینجوتسو هستند.

دانستنی‌ها

• موموشیکی ادعا کرده است که اطلاعات دقیقی از هر شینجوتسو دارد، و ادعای آمادو مبنی بر اینکه توانایی جذابیت ایدا یک شینجتسو است را رد کرد، زیرا هرگز در مورد آن چیزی نشنیده بود.
• تسلط هاگورومو اوتسوتسوکی بر نینشو شباهت‌های زیادی به شینجوتسو داشت، از جمله توانایی خلق حیات از هیچ و عدم نیاز به مهر دست برای اجرای تکنیک‌ها.